Sous la responsabilité de la directrice de l’inventaire du patrimoine et avec l'aide d'une secrétaire qui assure le suivi administratif et l'accueil du public, l’équipe composée de 18 personnes est organisée en trois pôles : pôle recherche, pôle technique et méthodologique, pôle documentation et valorisation :

• Les chercheurs réalisent les études (enquêtes de terrain, recherches dans les services d'archives, rédaction des dossiers d’inventaire, publications et diverses actions de diffusion ou de formation…) ; ils encadrent également les études menées par le réseau de l’inventaire général du patrimoine culturel (collectivités territoriales, parcs naturels régionaux, universités…).

• Les photographes, dessinateurs et cartographes produisent la très importante documentation illustrée nécessaire à la recherche et à sa valorisation, selon des procédés techniques spécifiques (photographies numériques de grands formats, photographies à la chambre, photogrammétrie, relevé d’architecture, cartographie électronique…).
  

• Les documentalistes, administrateurs ou gestionnaires de données et les assistantes accompagnent les chercheurs dans l’élaboration de dossiers documentaires et participent à la diffusion des résultats de la recherche au centre de documentation et par internet ; ils garantissent, avec les photographes, la conservation à long terme des fonds iconographiques suivant des principes de rigueur, de fiabilité et d'accessibilité.